Funcionamento atual:

Foi criado no "Contas a Pagar" um título para pagamento e foi classificado seus detalhes. No momento da importação do movimento bancário o sistema concilia identificando a similaridade pela Data e Valor e as opçoes são deletar o titulo do contas a pagar e importar o novo OU manter  ambos lançamentos, dessa forma sou obrigado a ir no Contas a Pagar efetuar o pagamento manual (botao pagamento) e somente nesse momento é vinculado ao lançamento importado levando os detalhes da classificação para o movimento da conta.

Sugestão:
Sugiro marcar como pago o título associado no contas a pagar já na importação do arquivo bancário que foi associado, dessa forma eliminaria o passo de manualmente marcar como pago o título e levando as classificações agilzando dessa forma o processo.